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1、区别：参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目,集中列表于文末；注释主要包括释义性注释和引文注释,一般排印在该页地脚或集中列于文末参考文献表之前。2、注释。是对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。为了保障原作者的著作权。3、参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T 7714—2005《文后参考文献著录规则》的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。”根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。
一、概念不同注释，是对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。二、分类不同注释：中国古代分得较细，分别称之为注、释、传、笺、疏、章句等。包含的内容很广。诸凡字词音义、时间地点、人物事迹、典故出处、时代背景都是注释对象。有脚注、篇末注、夹注等形式。古籍注释列在正文之中，有双行夹注和夹注。现代书籍注释列于正文当页之下，称脚注，亦称本面注；列于文章之后或列于书籍之后者称篇末注。不管采用何种方式，全书注文的编排一般要求统一，以便于读者查考。
如果论文中某句话是直接引用别人论文的内容，就加注释。如果在写论文过程中看了别人的文章并有所启发，但没有直接引用别人的观点，那就加参考文献。一般注释需在正文中有序号与之一一对应，但参考文献只需在文章最后列出所有你在写文章时参考过的文章即可。
关于二者的区别，《中国学术期刊(光盘版)技术标准规范》明确从内容、形式、编排位置等方面试图对二者做出区分。“参考文献是作者写作论著时所参考的文献书目，一般集中列表于文未;注释是对论著正文中某一特定内容的进一步解释或补充说明，一般排印在该页地脚。参考文献序号用方括号标注，而注释用数字加圆圈标注(如①、②)。”这种规定，努力将二者区分开来，在实际写作中也具有较强的可操作性，并在实际操作中常常出现这样两种情况：一是引文一律被当作参考文献处理，二是论文中的注释极少或者说大多没有。
引文是在文章中直接引用他文的某句话，注意，是一字不改原封不动的那句话；参考文献是将别人文献中的一些思想用自己的语言在自己的文章中表达。
注释是对论文中不详细的地方进行的解释,为了不影响篇幅所以单独列出引用是指论文中引用别人的观点,尊重知识产权，也为了不负责任，所以标明。参考文献是指本文写作过程中所学习过的文献，一般标注在文章末尾。注释一般放在说明位置，以括号标明。引用在论文中间标序号，然后在当页的页脚标出，也是脚注，参考文献列在论文的最后。
文献就是比人写的文章。参参考文献，就是你看了别人的文章还用了别人文章里的话。
注释是对论文中不详细的地方进行的解释,为了不影响篇幅所以单独列出引用是指论文中引用别人的观点,尊重知识产权，也为了不负责任，所以标明参考文献是指本文写作过程中所学习过的文献。注释一般放在说明位置，以括号标明。引用在论文中间标序号，然后在当页的页脚标出，也是脚注，参考文献列在论文的最后。
参考文献是你作论文时所用到的资料，一般要标注在论文最后。文献综述是论文中对你所要研究的问题利用前人已有的理论进行描述。建议你看一篇硕士或者博士毕业论文，就会明白的。
文献是指文献综述吧，文献综述是写论文之前导师要求您阅读大量资料之后自己总结出来的一篇文章，对你的论文会有一定的帮助，是你前人资料的整理，概括。而参考文献是指你阅读过哪写文章或者书籍的罗列，写在论文的最后，只写标题作者出版日期之类。
我们从事论文多年，我们认为是可以的。参考文献是放在最后的，引证文献也可能是参考文献，也可能是脚注或者尾注！