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专著《严嵩传》,独著,35万字,黄山书社,1992年7月《中国经济通史·明代经济卷》,第二副主编并撰稿,90万字,经济日报出版社,2000年8月第1次印刷,2007年再版,国家社科“七五”重点科研课题,国家“九五”重点图书,中国社会科学院优秀科研成果奖《孙奇逢评传》,独著,5万字,中州古籍出版社,2003年9月,编入张显清主编《孙奇逢集》中册《明代政治史》,第一主编,98万字,广西师大出版社,2003年12月第1次印刷,2006年11月第2次印刷,国家社科基金项目,中国社会科学院历史研究所优秀科研成果奖《祸国宰相严嵩》,独著,16万字,中国社会科学出版社,2008年4月《明代后期社会转型研究》,主编并撰稿,61万字,中国社会科学出版社,2008年11月,中国社会科学院重大课题(B),纳入中国社会科学院文库文集《张显清文集》,独著,9万字,上海辞书出版社,2005年5月论文(除注明者外皆为独著)(一)社会经济《明代缙绅地主浅论》,3万字,《中国史研究》1984年第2期《明代官绅优免与庶民中户的徭役负担》,7万字,《历史研究》1986年第2期《明代土地投献简论》,4万字,《北京师院学报》1986年第2期《明代缙绅地主减价买田事例》,1万字,《中国史研究》1986年第2期《论严嵩的家资》,5万字,《北京师院学报》1990年第2期《论明代官绅优免冒滥之弊》,2万字,《中国经济史研究》1992年第4期《近二十年来国内关于明代社会变迁问题研究状况读书札记》,1万字,《中国史研究动态》2003年第4期《近三十年来国外关于明代社会变迁问题的研究状况》,8万字,《明史研究》第8辑,2003年12月《中国历史“停滞论”的由来和发展》,7万字,《明史研究》第8辑,2003年12月《明代后期粮食生产能力的提高》,2万字,《中国社会科学院学术委员会集刊》第1辑,2005年;《学术探索》2005年第5期及中国人民大学书报资料中心《经济史》2006年第1期转载《明代后期农业商品化程度的提高与社会经济结构、农业生产关系的变化》,3万字,《纪念许大龄教授诞辰八十五周年学术论文集》,北京大学出版社,2007年12月《晚明社会的时代特点》,3万字,《河南师大学报》社科版,2005年第6期。中国人民大学书报资料中心《明清史》2006年第2期转载《晚明:中国早期近代化的开端》,8万字,《河北学刊》,2008年第1期;《新华文摘》2008年第8期及中国人民大学书报资料中心《明清史》2008年第5期转载(二)政治《从〈大明律〉和〈大诰〉看朱元璋的“锄强扶弱”政策》,8万字,《明史研究论丛》第2辑,1983年6月《明代亲藩由盛到衰的历史演变》,9万字,《社会科学战线》1987年第2期《明嘉靖“大礼议”的起因、性质和后果》,4万字,《史学集刊》1988年第4期《〈大明律〉的形成及其反映的时代特点》,7万字,《中国史研究》1989年第4期《封建家法是封建国法的补充》,9万字,《谱牒学研究》第1辑,1989年12月《“以媚术宠”是严嵩政治品格的典型特征》,8万字,《严嵩与明代政治论文集》,上海社会科学院出版社,1989年12月《修仙皇帝》,笔名程德,1万字,王春瑜主编《明宫秘闻》,江苏古籍出版社,1992年1月《明末北直清流派的形成及其反阉党斗争》,2万字,《明史研究》第3辑,1993年《“洪武重典”说辨析》,日本《明代史研究》第28号,2000年4月《关于明代倭寇性质问题的思考》,2万字,《明清论丛》第2辑,2001年《试论明太祖“以教化为本”的治国思想与实践》,2万字,《明史研究》第7辑,2001年《贵州建省:贵州历史的里程碑》,2万字,《纪念贵州建省590周年学术讨论会文集》,贵州人民出版社,2004年《廓清对郑和远航动因的曲解》,8万字,《纪念郑和下西洋600周年国际学术论坛论文集》,社科文献出版社,2005年《略论郑和远航的动因及其历史意义》,7万字,《中国远洋航务公告》2005年第7期《“踪迹建文、耀兵异域”说质疑――纪念郑和远航600周年》,2万字,《中国社会科学院学术咨询委员会集刊》第2辑,2006年2月《明太祖朱元璋社会理想、治国方略及治国实践论纲》,5万字,《中国社会科学院学术咨询委员会集刊》第3辑,2007年(三)农民起义《王守仁镇压农民起义的反动策略》,7万字,《农战史论丛》第1辑,1978年12月《研究明末农战史的一部重要历史文献——〈杨文弱集〉》,8万字,《文献》第1辑,1980年1月《张献忠与西方自然科学——读〈圣教入川记〉》,8万字,《农战史论丛》第3辑,1981年4月《关于成化年间“妖书妖言”案的史料》,4万字,《明史研究论丛》第3辑,1985年5月《张献忠“谷城受抚”评析》,1万字,《明史研究》第1辑,1991年9月(四)思想文化《论王阳明鼓吹蒙昧主义的反动性》,7万字,《山东师院学报》1979年第1期《论海瑞的社会政治思想》(合著),8万字,《北方论丛》1980年第4期《徐光启社会经济思想的几个问题》,3万字,《晋阳学刊》1981年第4期《晚明心学的没落与实学思潮的兴起》,6万字,《明史研究论丛》第2辑,1982年4月《王守仁的唯心史观》,8万字,《浙江学刊》1985年第4期《明代社会思想和学风的演变》,4万字,《中国哲学史研究》1986年第2期《孙奇逢的“以实补虚”论》,8万字,《中州学刊》1986年第6期《孙奇逢的“以实补虚”论》,3万字,《明清实学思潮史》第25章,齐鲁书社,1989年7月《张溥及复社“兴复古学,务为有用”的经世思想》,2万字,《明清实学思潮史》第29章,齐鲁书社,1989年7月《陈子龙的实学建设》,5万字,《明清实学思潮史》第31章,齐鲁书社,1989年7月《试论阳明心学的历史作用》,5万字,《孔子研究》1990年第2期《明清实学思潮及其对日本思想文化的影响》,日本《明代史研究》,1991年3月《绚丽的台湾历史风情画卷——读〈台海采风图考〉》,3万字,《史学集刊》1992年第2期《朱元璋尊孔抑孟刍议》,5万字,《北方论丛》1992年第5期《明清之际杰出教育家孙奇逢述论》,1万字,《清史研究》1993年第2期《简论孙奇逢兼容并包的治学方针》,6万字,《晋阳学刊》1993年第3期《徐光启引进和仿制西洋火器述论》,7万字,澳门《文化杂志》第13、14期,1993年第2季度《科举制历史作用刍议》,75万字,《中国社会科学院研究生院学报》1998年第1期《陈子龙:晚明实学思潮的健将——兼论明清实学思潮的一些问题》,1万字,《明史研究》第6辑,1999年5月《略论中国传统文化的整体观》,4万字,《光明日报》1999年4月2日《要重视明清之际人士文集的整理和研究——以〈孙奇逢文集〉为例》,3万字,《明人文集与明代研究》,台湾乐学书局,2001年《传统与启蒙》,9万字,《明代文化研究》,中国文史出版社,2003年9月《大运河:中国早期启蒙思想的摇篮》,3万字,《运河之都——淮安全国学术研讨会论文集》,中国书籍出版社,2007年《试析明定陵考古发掘的学术和社会意义》,8万字,《世界文化遗产——明清皇家陵寝保护与发展研讨会论文集》,北京燕山出版社,2007年7月(五)序文、评论《名相传》序,海南出版社,1994年王俞春编著《海南进士传略》序,花城出版社,1998年卞利著《胡宗宪评传》序,中国文联出版社,2001年宠中威著《定陵发掘亲历记》序,学苑出版社,2002年《孙奇逢集》总序,中州古籍出版社,2003年梁颂成辑校《杨嗣昌集》序,岳麓书社,2005年;《湖南文理学院学报》(社科版)2006年第2期转载赵克生著《明朝嘉靖时期国家祭祀改制》序,社会科学文献出版社,2006年郭培贵著《明史选举志考论》序,中华书局,2006年明孝陵博物馆编《明孝陵碑刻》序,广陵书社,2006年明孝陵博物馆编《明帝王陵碑刻精品》序,广陵书社,2009年胡凡著《明代历史探赜》序,中国大百科全书出版社,2009年读汤纲、南炳文著《明史》,《光明日报》1992年6月28日评《朱元璋研究》(陈梧桐著),《中国史研究动态》1994年第6期《家长制专制封建社会论——记近年来王毓铨先生对明代及中国封建社会形态基本特征的论述》,5万字,《明史研究》第4辑,1994年《他们赢得了赞誉》,《中国社会科学院院报》2000年12月12日《重要的在于科学地说明历史——评沈定平著〈明清之际中西文化交流史〉》,《中华读书报》2002年1月16日《增强使命感 深化历史学研究》,《光明日报》2002年5月28日《发挥优势 承担重任》,《中国社会科学院院报》2002年7月30日(六)纪念吴晗《〈吴晗史学论著选集(第一卷)〉读后》,5万字,《晋阳学刊》1985年第3期《吴晗与明定陵的发掘》,2万字,《中国社会科学院院报》2002年1月15日;《科学中国人》2002年第9期转载《难忘的四年——缅怀吴晗先生》,55万字,《求真务实五十载——历史研究所同仁述往》,中国社会科学出版社,2004年吴晗著《明史简述》导言,25万字,中华书局,2005年《谈谈吴晗的历史贡献》,3万字,《中国社会科学报》2009年10月29日《从创造到普及:吴晗先生的学术贡献》(与赵克生合著),5万字,《古代文明》2009年第3期;《新华文摘》2009年第19期转载古籍整理、辞书:《谷山笔麈》(于慎行著),合作点校,10万字,《明史资料丛刊》第3辑,《清代台湾农民起义史料选编》,6万字,合编,主持人,福建出版社,1983年《曲阜孔府档案史料选编》,大型集体项目,齐鲁书社《中国事典》明代卷主编之一,明代卷100万字,沈阳出版社,1992年7月《中国历代治国策选粹》明代卷编委之一,明代卷30万字,高等教育出版社,1994年《文白对照二十五史精华》,编委会委员,海南出版社、三环出版社,1993年《名相传》(《文白对照二十五史分类传记》),主编,3万字,海南出版社,1994年《余冬序录》(何孟春著),6万字,《中华野史·明代卷》,泰山出版社,1999年《孙奇逢集》,主编,304万字,中州古籍出版社,2003年《中国大百科全书》、《不列颠百科全书》等辞书某些辞条的编写
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《明代宫廷教育思想初论》,《求是学刊》2015年第2期。《怀柔远人:国史〈明实录〉对西域“回回”记载的价值取向》,《北方民族大学学报》2015年第2期。《明清实录对武当山记载的差异》,《南都学坛》2015年第2期。《〈湖北天门熊氏契约文书〉的学术价值》,《中华读书报》2015年2月4日第15版。《〈清实录〉修纂中的汉化现象论析》,《华中国学》第三卷,华中科技大学出版社2015年1月,第311—324页。《论中国史学谱系的层累与延展——兼论中国史学史体系的发展模式》,《人文杂志》2014年第8期。《历史与社会(文摘)》2014年第4期转载;又《中国社会科学文摘》2015年第1期转载。《王士祯家族历史撰述初探》,《中原文化研究》2014年第5期。《明代皇室子弟教育初论》,《长白学刊》2014年第4期。《中国宫廷的游戏与娱乐》,《紫禁城》2014年第2期。《〈宋实录〉川蜀作者群初探》,《四川师范大学学报》2014年第1期。《〈翁心存日记〉所见〈清宣宗实录〉版本考》,《文献》2013年11月第6期。《论国学的学格》,《光明日报》2013年8月26日第15版“国学版”。《试析〈明实录〉对刘基形象的记载与塑造》(与谢盛合作),《学术研究》2013年第5期。《〈宋实录〉河南作者群初探》,《中原文化研究》2013年第4期。《〈清实录〉的文献价值与文本解析》,《河南大学学报》(社会科学版),2013年第4期;又中国人民大学复印报刊资料《历史学》2013年第10期转载。《试论〈清实录〉在整饬吏治中的指导性作用》,《北京联合大学学报》2013年第3期。《民国学者应用、整理和研究〈清实录〉初探》,《四川师范大学学报》2013年第1期。《试论儒学思想在史学实践中的贯彻》,《学习与实践》2012年第5期。《从〈翁心存日记〉看清代实录馆的修纂与运作》,《史学史研究》2012年第4期。《试述〈清实录〉史料的来源与流向》,《北京联合大学学报》2012年第2期;又《人大复印资料·明清史》2012年第8期转载。《实录体史书在中国文化承传上的特殊贡献》,《人文杂志》2012年第1期。《中西比较视野下的中国皇帝实录》,《人文论丛》2011卷,中国社会科学出版社2011年。《试述〈明实录〉对武当山的记载及其价值》,《江汉论坛》2011年第12期;又收入《故宫·武当山研讨会论文集》,故宫出版社2012年。《王朝与天下之辨:明末清初“新民本”对君主私天下本质的揭露》,《明史研究论丛》第9辑,紫禁城出版社2011年。《从〈清实录〉看海南的航海与海盗问题》(与谢盛合作),《新东方》2011年第3期。《欲乐还忧:崇祯宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2011年第6期。《化神奇为腐朽——明熹宗宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2011年第5期。《追回失去的快乐——明神宗后期宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2011年第4期。《没有快乐的童年——明神宗早期宫廷娱乐生活》(与谢盛合作),《紫禁城》2011年第3期。《压抑后的“井喷”——明穆宗的宫廷娱乐生活(与谢盛合作),《紫禁城》2011年第2期。《修醮宴安求长生——明世宗的宫廷娱乐生活》(与谢盛合作),《紫禁城》2011年第1期。《试述〈明太宗实录〉对建文帝形象的描写与塑造》,《学习与探索》2011年第1期。《从历史与新闻的关系看史学的传播和普及》,《郑州大学学报》2011年第1期。《明宣宗宫廷娱乐生活特征与影响述论》,载《明永乐宣德文物特展·永宣时代解读》,紫禁城出版社2010年;又载《永宣时代及其影响——两岸故宫第二届学术研讨会论文集》,故宫出版社2012年。《论儒学与史学的关系——以儒学对实录体史书编纂的影响为例》,载《中国的思想与社会——历史研究的回顾、探索与展望》,上海大学出版社2010年。《张舜徽中华人民通史新探》,《华中学术》第二辑,华中师范大学出版社2010年。《〈清实录〉世传版本考》,《明清论丛》第十辑,紫禁城出版社2010年。《试述〈明太祖实录〉对朱元璋形象的塑造》,《学术研究》2010年第5期。《试论〈明实录〉对建文帝的态度及其变化》,《北京联合大学学报》2010年第3期;《人大复印资料·明清史》2011年第1期转载。《逐步突围——明武宗娱乐生活的阶段性特征(下)》,《紫禁城》2010年第9期。《逐步突围——明武宗娱乐生活的阶段性特征(上)》,《紫禁城》2010年第8期。《突破围城(下)——明武宗肆无忌惮的娱乐生活》(与谢盛合作),《紫禁城》2010年第7期。《突破围城(上)——明武宗肆无忌惮的娱乐生活》(与谢盛合作),《紫禁城》2010年第6期。《滑向逸游:明宪宗与明孝宗的宫廷娱乐》,《紫禁城》2010年第5期。《儒家伦理与皇帝私欲的冲突与折衷——明英宗与明代宗的宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2010年第4期。《促织瞿瞿叫,宣德皇帝要——明宣宗骄奢荒唐的宫廷娱乐》,《紫禁城》2010年第3期。《新年共乐逢亨运,多寿惟惭祝眇躬——明宣德年间的宫廷节庆娱乐》,《紫禁城》2010年第2期。《红叶舞丹霜后落,青山如画马前看——明宣宗的效游和巡游》,《紫禁城》2010年第1期。《明实录所见登州的对外往来》,《登州与海上丝绸之路》,人民出版社2009年。《明代宫廷修书仪制考述》,《故宫学刊》总第五辑,紫禁城出版社2009年。《朝回足清暇,抚景情更怡:明宣宗的宫廷游乐活动》,《紫禁城》2009年第12期。《闲暇琴书足自娱,每从周孔溯唐虞:宣宗的宫廷文艺娱乐》,《紫禁城》2009年第11期。《天理与人欲的动态平衡:明宣宗宫廷娱乐生活特征》,《紫禁城》2009年第10期。《从心所欲不逾距:明成祖的宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2009年第9期。《围城里的陶醉:明太祖的宫廷娱乐生活》,《紫禁城》2009年第8期。《〈宋实录〉史料的来源与流向》,《武汉大学学报》2009年第4期。《中国历史文献学与中国史学史的交叠与分野》,《湖北大学学报》2009年第2期;《人大复印资料·历史学》2009年第7期转载。《皇史宬尊藏〈清实录〉考》,《故宫博物院院刊》2009年第1期。《论儒臣与宦官对明代皇帝娱乐的影响及较量》,《故宫博物院院刊》2008年第6期。《清实录宫藏版本考》,《中国历史学会史学集刊》(台湾),第40期,2008年。《利玛窦“送礼”初探》,(澳门)《文化杂志》2008年春季刊。《〈清实录〉稿底正副本及满汉蒙文本形成考论》,《史学集刊》2008年第2期。《明代的〈汉书〉经典化与刘邦神圣化的现象、原因与影响》,《长江大学学报》2008年第2期。《从英法德意俄美汉译国名的演变看中国人对西方列强的认知过程》,载《语义的文化变迁》第145~173页,武汉大学出版社2007年。《五代实录修纂考》,《人文论丛》2005年卷,武汉大学出版社2007年。《唐五代实录修纂机构考述》,《历史文献研究》总第26辑,华中师范大学出版社2007年。《中国实录体史学研究:让中华文明的特色更鲜明》,《社会科学报》(上海)2007年5月17日。《实录修撰与少数民族政权的汉化》,《中南民族大学学报》2007年第1期。《朱熹修纂〈宋高宗实录〉考论》,《朱子学刊》2006年第1辑(总第16辑),黄山书社2006年。《司马迁所创纪传体对实录体的影响》,《史记论丛》第三集《逐鹿中原》,陕西人民教育出版社2006年。《从边缘到中心:明清实录对东北历史观察视角的转换》,《学习与探索》2006年第6期。《从唐实录体裁看实录体的特征与地位》,《长江大学学报》2006年第5期。《〈宋钦宗实录〉的修纂与价值》,《史学史研究》2006年第4期。《明代西器东传探研》,《兰州大学学报》2006第1期。《〈唐太宗实录〉的修纂及历史影响》,《湖北行政学院学报》2006年1期。《明实录职官校正》,《历史文献研究》总第24辑,华中师范大学出版社2005年。《〈大明志书〉修纂及特点考论》,《明清安徽典籍研究》,黄山书社2005年。《饶宗颐对史学正统论研究的学术贡献――〈中国史学上之正统论〉发微》,《史学理论研究》2005年第2期;《人大复印资料·历史学》2005年第9期转载。《张居正官史修纂的革新措施》,《长江大学学报》2005年1期。《明至清中叶长江流域的西器东传》,《中国文化》第21期,2004年6月。《谶谣:一种特殊的社会语言》,《社会学家茶座》总第7辑,2004年第2辑,山东人民出版社2004年。《明末清初新民本思想家建立新型君臣关系的尝试》,《历史文献论集》,崇文书局2003年。《试论明末清初“新民本”思想》,《江汉论坛》2003年10期;《人大复印资料·明清史》2004年2期。《西器东传与前近代中国社会》,《学术月刊》2003年8期;《人大复印资料·明清史》2003年6期转载。《试析章学诚妇女观及对其史学观的影响》,《湖北行政学院学报》2003年第3期。《评中国古代史学的“史才”论》,《史学史研究》2003年3期。《〈明夷待访录〉的近代“误读”与“新民本”思想的历史影响》,《哲学研究》2003年第2期。《“国民性改造运动”与中国民族旅游性格的重塑》,《人文论丛》2001卷,武汉大学出版社2002年。《试论直书与曲笔对明实录价值的影响》,《历史文献研究》总第21辑,华中师范大学出版社2002年。《从唐甄对君民关系的考察看其新民本思想》,《武汉大学学报》2002年第5期。《明代起居注的兴废及其对明实录修纂的影响——兼论儒家意识与君主专制的冲突与摩擦》,《史学月刊》2002年第4期。《明代史馆探微》,《史学史研究》2000年2期;《人大复印资料·历史学》2000年8期转载。《张舜徽与二十世纪后半叶的国学研究》,《求索》2001年第6期。《明代国史与野史的生态关系——以〈明实录〉的禁藏与流传为线索》,《学术月刊》2000年5期。《从唐甄的旅游观看中国文化的转型》,《旅游学刊》2000年3期。《明实录修纂程序述要》,《武汉大学学报》2000年1期。《略论中国传统旅游的人文精神》,《人文论丛》1999年卷,武汉大学出版社1999年。《明实录修纂考述》,《历史文献研究》总18辑,华中师范大学出版社1999年。《中国传统旅游的伦理特征》,《旅游学刊》1999年第4期。《直书与曲笔:传统修史原则的一体二翼》,《学术月刊》1999年3期。《睿宗、崇祯及南明诸朝实录修纂考述》,《史学史研究》1999年第2期。《明实录研究述略》,《人文论丛》,武汉大学出版社1998年。《试论〈洪芳洲公文集〉的史料价值》,《洪芳洲研究论集》,台湾洪芳洲研究会1998年。《从宋明家庭经济的经营看中国文化的转型》,《中南民族学院学报》1998年1期;《人大复印资料·宋辽金元史》1998年第3期。《从明代城市功能的转变看中国文化的转型》,《中国前近代史理论国际学术研讨会论文集》,湖北人民出版社1997年。《张舜徽清代学术史研究初论》,《华中师范大学学报》1997年11月专辑。《朱元璋历史观与史学思想初探》,《江汉论坛》1997年5期。《明实录体裁与体例研究》,《史学史研究》1997年第3期。《会通思想及其历史回声》,《船山学刊》1997年1期。《明实录的版本与收藏》,《文献》1997年1期。《明实录修纂与明代政治斗争》,《武汉大学学报》1997年第1期;《人大复印资料·历史学》1997年第3期转载。《明实录主题思想及民族史料价值》,《中南民族学院学报》1996年4期。《试论〈殷虚书契考释〉的方法和价值》,《历史文献研究》(北京新六辑)1995年10月。《大戴礼记经文校正》,《文史》第39辑,中华书局1994年。《从朱元璋的正统观看他对元蒙的政策》,《华中师范大学学报》1994年第1期。《明实录人名校勘补遗》,《历史文献研究》(北京新四辑),燕山出版社1993年。《朱元璋偶像崇拜与政策走向》,《安徽史学》1993年第2期。《谣谚与古代教育及科举》,《中国典籍与文化》1993年第2期。《史记人民性悖论》,《华中师范大学学报》1992年第6期;《人大复印资料·历史学》1993年第1期转载。《明实录地名校勘》,《华中师范大学学报》1992年第1期。《明实录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