“十一五”期间获科研课题212项，其中教育部社科基金1项，到位科研经费年均增长达到105%，教师出版著作10部，获授权专利9项，其中发明专利5项。科研成果通过鉴定6项，获奖78项，其中2项产学研项目获教育部科技发展中心表彰 。2013年，三明学院共有8个项目获得省科技厅立项，共获得资助经费5万元。其中福建省自然科学基金3项（13万元）、福建省重点项目3项（30万元）、福建省高校产学合作科技重大项目1项（50万元），福建省软科学项目1项（5万元） 。7个项目获省社会科学规划项目立项，共计经费5万元 。国家自然科学基金项目2项，资助经费共50万元 。在福建省教育评估研究中心公布的2012年度福建省普通高等学校内涵建设主要评价指标（一般本科高校）中，学校获得了“科研创新平台”列第一位；“年度科研成果转化（万元）”等列第二位；“年度省级以上科研成果奖”、“年度科研成果转化（项）”等列第三位；“年度横向科研经费”、“年度科研经费”等列第四位。 据2015年6月官网显示，学校建成校级研究所12个。拥有省级科研团队1个，省部级重点实验室2个，福建省高校服务海峡西岸经济区建设重点项目8个，省级创新平台12个，培育省级“2011协同创新中心”1个。省级工程技术研究中心：福建省固定床洁净煤气化工程技术研究中心、药用植物开发利用工程研究中心、三明机械CAD工程研究中心 省级重点实验室：福建省材料工程与结构加固重点实验室省级人文社会科学研究基地：三明学院生态文化研究中心研究所：福建省三明汽车工程研究所、闽台林业研究所、客家文化研究所、计算机应用技术研究所、林产化学与涂料研究所、应用生物技术研究所、资源开发与规划研究所、CAD/CAM技术研究所、生态文化与地方文化研究所、应用化学与化工研究所。其他还有复旦大学——三明学院天然药物工程研究中心、福建省中药材草珊瑚规范化种植科技示范基地、海峡动漫游研发与制作中心等科研机构 。 期刊学报 《三明学院学报》创刊于1984年，2010年由季刊改为双月刊。被评为“全国优秀社科期刊”、“全国地方高校优秀学报”。被中国期刊网、中国学术期刊（光盘版）、中国学术期刊综合评价数据库、万方数据—数字化期刊群等多家数据库和检索期刊收录 。 馆藏资源 截至2011年12月31日，馆藏纸质文献总量58万册，电子图书71万册，报刊1733种。积累和保存了明末版《玉海》、清版《四库备要》、民国版《万有文库》等历史参考价值较高的古籍文献15万册 。
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