厦门大学的化学还是非常不错的,尤其是电化学和物理化学,近年来在高水平论文上取得了重大进展,在nature,science上都曾发表过文章,由于在nature及其子刊上发表的高水平工作,厦大在2011年自然出版集团发表的“中国自然出版指数”中名列第九,前十位依次是中国科学院、清华大学、中国科技大学、深圳华大基因研究院、北京大学、南京大学、香港大学、东南大学、厦门大学和浙江大学。虽然这个排名不一定十分科学,但至少显示厦大在高端成果上还是不错的,而且据我所知,厦大的高端论文主要来自于化院和生命科学院。从经济角度考虑,厦大化院的研究生待遇也还不错,大幅提高了2012级研究生的补贴标准,具体可见其网站公告。同济的情况不了解,不敢妄下结论,不过个人觉得厦大化院无论是学风、科研条件、师资队伍(8个院士)等方面都是不错了,推荐报考!