截至2014年5月，学校有1个国家级野外观测站，2个教育部省部共建重点实验室，1个国家林业局重点实验室，8个自治区重点实验室，3个自治区工程技术中心，2个高校重点实验室，2个自治区人文社科基地，2个自治区高校重点实验室（工程研究中心）培育基地，1个教育部科技创新团队，7个自治区候选科技创新团队。国家级野外观测站：大兴安岭森林生态系统国家野外科学观测研究站国家级特色优势学科专项资助实验室：“畜产品加工”实验室国家工程实验室工艺技术研究室：兽用疫苗研究室中央地方共建实验室：沙生灌木材料科学与技术中央地方共建实验室教育部省部共建重点实验室：“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室、教育部“草地资源重点实验室”农业部重点实验室：动物疾病临床诊疗技术重点实验室国家林业局重点实验室：国家林业局 “沙地生物资源保护和培育” 重点开放实验室财政部与地方共建的高校特色优势学科实验室：草食家畜诊断实验室教育部工程研究中心：“乳品生物技术”研究中心自治区重点实验室：动物遗传育种与繁殖学自治区重点实验室、基础兽医学内蒙古自治区重点实验室、动物生物技术内蒙古自治区重点实验室、“内蒙古野生特有蔬菜种质资源与种质创新”自治区重点实验室、“内蒙古作物栽培与遗传改良”自治区重点实验室、“内蒙古自治区沙地（沙漠）生态系统与生态工程”重点实验室、水资源利用与保护实验室为自治区重点实验室、森林培育林木菌根生物技术自治区重点实验室、内蒙古动物遗传繁育重点实验室自治区重点实验室（培育）：动物营养与饲料自治区重点实验室（培育）自治区重点开放实验室：“乳制品研究”自治区重点开放实验室自治区工程技术中心：沙生灌木资源开发利用工程技术研究中心、“内蒙古自治区草品种育繁工程研究中心”、“畜产品加工”内蒙古工程技术研究中心、“内蒙古自治区草品种育繁工程研究中心” 截至2014年5月，学校在研的科研项目总数776项，总经费84亿元。2006-2014年5月，学校共承担国家和省部级在研项目数1180余项，项目总经费6亿元，这些项目包括国家863、国家973、国家重大科技专项、国家科技支撑、国家农业成果转化资金项目、国家自然科学基金等。其中，国家自然科学基金458项，总经费39亿元，列全国农林院校的第6位。获得省部级三等奖以上奖74项，其中一等奖8项；作为主要完成单位获得国家科技进步二等奖4项。英国著名杂志《Nature》（《自然》）评出了2012年度自然出版指数中国前100强单位，内蒙古农业大学名列第52位，排名在中国农大、四川农大、南京农大、华南农大之后，居农业高校第5位。自然出版指数（NPI）是针对在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数，可以被用来作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。2012年，内蒙古农业大学与上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究院、南开大学、上海生物技术研究中心等研究机构的科研人员合作，完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作。该项研究成果在《Nature》子刊《Nature communications》上作为封面文章在线发表。 农大学报《内蒙古农业大学学报》创刊于1957年，当时刊名为《内蒙古畜牧兽医学院院刊》（内蒙古农业大学创建于1952年，当时校名为内蒙古畜牧兽医学院）。是内蒙古高校创办最早的学报，也是内蒙古创办最早的科技期刊之一。1999年，原内蒙古农牧学院和原内蒙古林学院合并成立新的多科性大学—内蒙古农业大学。学报更名为《内蒙古农业大学学报》，分自然科学版和社会科学版两种版本发行。2002年创办《内蒙古农业大学学报》（蒙古文综合版），在内蒙古自治区内部交流发行。 图书馆1999年4月12日由原内蒙古农牧学院图书馆和原内蒙古林学院图书馆合并组建为内蒙古农业大学图书馆。截至2012年3月，馆舍面积3万平方米，分设西、北校区馆，总馆在西校区。阅览席位2570个。文献资源建设上，以收藏农业科学文献为主，是内蒙古自治区农、林、牧文献信息资源收藏最丰富的图书馆，馆藏纸质文献7万册，中外文期刊1185种，电子图书120万册，创建个人数字图书馆500个。拥有48个中外文数据库，其中引进SCI、EI、Willy等权威外文数据库9个，2个自建特色数据库。集成化管理上，在内蒙古自治区高校图书馆中首先建设完成以CISCO-4006为核心交换机和21台接入交换面组成的千兆连接校园网、百兆到桌面的有线和无线信息网络系统，存储量为24TB，提供24小时全天候网络服务，并设立了西部地区最大的托福考点和西部地区唯一的GRE考点，电子阅览室设有280台计算机。
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