《诸病源候论》虽然是探讨病因证候的专著,但也叙述了不少有关治疗创伤的外科手术方法和缝合理论等。这些创造性成就,说明我国外科手术治疗在继承汉晋以来所取得的成就的基础上,在隋代又有了新的进步,达到了更高的水平。例如书中所载的肠吻合术,对手术步骤、方法等要求很严格,其中尤其创造性地提出了富有科学性的缝合理论原则和具体详尽的缝合方法,对术后护理也有具体合理的要求。其缝合断肠的原则和护理要求,至今还是外科医师进行这种手术的注意要点。欧洲最早的同类手术,是意大利人罗格与罗兰在12、13世纪间进行的,比巢氏等人所载晚了500多年。在书中所载的处理腹部外伤、切徐大网膜的手术中,还创造了结扎血管的方法。即做这种手术时,在手术步骤上要求首先注意结扎血管,借以观察该血管营养区域并按此区域切除已坏死的大网膜。如此则可避免单纯切除局部而引起继发的感染、坏死,这是很正确的原则,是一项重要的科学发明。意大利著名外科学家伯特帕格利于1460年创造了一般结扎血管和出血创口内贯穿结扎血管的方法,另一位外科学家埃伯罗易斯帕勒(1517~1590)在截肢术中,应用了大血管的结扎方法。《诸病源候论》所载的同类方法虽尚不如他们具体,但较他们要早800多年。书中还建立了创伤内异物剔除的原则,其所论述的具体要求与现代医学关于创伤内异物剔除原则是相符的。