2008年和2009年本刊连续2次荣获“中国百种杰出学术期刊” 称号；2008年本刊在中文核心期刊基础医学类排名第一；并被评为“中国精品科技期刊”。 [到目前为止，《中国病理生理杂志》已被国内《中文科技期刊数据库》
中国病理生理杂志是中国病理生理学会的会刊，中国病理生理学会（以下简称本学会）是中国病理生理科学工作者及相关单位自愿结成的、依法登记成立的全国性、学术性和科普性的法人社会团体，
在2014版北大中文核心期刊目录未出版之前，还是以目前还是2011版为准。《中国病原生物学杂志》 目前是 北大中文核心期刊。算是国家级核心期刊。
基础医学类核心期刊1、中国病理生理杂志2、中华微生物和免疫学杂志3、生物医学工程学杂志4、解剖学报5、中国免疫学杂志6、免疫学杂志7、细胞与分子免疫学杂志8、中国临床解剖学杂志9、生理学报10、解剖学杂志11、中国心理卫生杂志12
医学核心期刊是指经中国新闻出版总署审批准后公开发行的医学学术期刊。1、《中国社区医师》:国内发行量最大的国家级综合性医学期刊、中国知网收录期刊、旬刊。2、《医学信息》:国内发行速度最快的国家级综合性医学期刊、
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