1、两者的内容不同：学术论文期刊是在某一学术课题具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录，毕业论文是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。2、两者的主体不同，
学术期刊刊发的文献以学术论文为主，而普通期刊刊发的文献则以文件、报道、讲话、体会、知识等只能作为学术研究的资料而不是论文的文章为主。学术期刊具有学术性、局域性，而普通期刊则具有大众性、普及性。
国家级核心期刊一般指的是《中文核心期刊要览》中所列期刊，有些学校中将中国科学引文数据库（CSCD）或中国科技核心期刊列为核心。因此，不同的系统和单位对核心期刊的要求不同，最好是先问清楚，求采纳为满意回答。
1、记录方式不同 文献是通过一定的方法和手段、运用一定的意义表达和记录体系记录在一定载体的有历史价值和研究价值的知识。论文常用来指进行各个学术领域的研究和描述学术研究成果的文章，简称之为论文。2、
期刊，也称杂志，辞海中期刊的定义是:由多位作者撰写的不同题材的作品构成的定期出版物。期刊主要是从英文"magazine"、"periodical"、"journal"三个词翻译过来，periodical的含义比较广，通常包括报纸(newspaper)与杂志。
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