学会主办了七种专业期刊，《中国免疫学杂志》、《Cellular & Molecular Immunology》、《免疫学杂志》、《中国肿瘤生物治疗杂志》、《上海免疫学杂志》、《 细胞与分子免疫学杂志》及《神经免疫学和神经病学杂志》。
医学核心期刊是指经中国新闻出版总署审批准后公开发行的医学学术期刊。1、《中国社区医师》:国内发行量最大的国家级综合性医学期刊、中国知网收录期刊、旬刊。2、《医学信息》:国内发行速度最快的国家级综合性医学期刊、
The Journal of experimental medicine，SCI收录期刊，研究领域主要是在医学方面。该杂志 在 IMMUNOLOGY (免疫学) 同类期刊中的影响因子排名第 5 位， 在 MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL (医学进展)
中华内分泌代谢杂志 中华麻醉学杂志 中华普通外科杂志 中华肾脏病杂志 中华烧伤杂志 中华实验外科杂志 中华手外科杂志 中华实验和临床病毒学杂志 中华微生物学和免疫学杂志 中华围产医学杂志 中华糖尿病杂志 中华物理医学与康复...
《中华医学杂志》是1915年创办的双语学术期刊，周刊，中国科学技术协会主管，中华医学会主办。期刊主要反映中国医学最新的科研成果，积极推广医药卫生领域的新技术、新成果，及时交流防病治病的新经验。
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