馆藏资源截至到2007年10月，图书馆馆藏文献量达26万册。包括印刷型图书18余万册，期刊合订本4余万册，馆藏文献中医药卫生类书籍89100余册，突显了我校专业特点。每年订有期刊530余种，报纸36种。期刊中医学类300余种（含外文4种），文艺类200余种。电子图书（光盘）4余万册，购买的资源有超星电子图书10万册、中国知网数据库、万方数据库、万方学术视频80000分钟。 学术期刊《重庆三峡医药高等专科学校学报》（以下简称《学报》）是由重庆市教育委员会主管、重庆三峡医药高等专科学校主办的综合性学术刊物。《学报》以弘扬医药文化，传播医药科学知识，繁荣医药学术，展示医药科研成果，为学校教学、医疗、科研服务，为重庆及三峡库区社会、经济、文化及医药卫生事业发展服务为宗旨的综合性学术期刊。
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