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‍‍这类没有自己生产的bench data的文章通常不太可能发布到最最顶尖的杂志，比如Nature或者Science的主刊。投文章时可以分为四个梯队：第一梯队：Nature Methods, 只要能发上面基本上就保证了关注度和引用，也会有很多人follow的；Genome Research, 很老牌的杂志了，文章的质量都很高，当然了editor大部分文章都是直接拒的。Nature Biotechnology,纯方法的文章很难发上来的，一般都是很大的组既有方法又有实验数据。楼主可参见Clinks和That那篇文章，很多个co-author，做了非常多的测序实验来验证。Nature Genetics，同样，很少有纯方法的文章，除非你在圈内已有很大影响力，比如CADD那篇文章。上面有一大堆做统计和GWAS的人，感觉不太欢迎machine learning的文章。第二梯队：Genome Biology, 比较新的杂志，近几年有一些不错的文章。Nature Communication, 非常新的杂志，基本上每期都会有一些生信类的文章。感觉影响因子在不断上涨，顶着Nature的头衔自然不会缺少好文章。审稿周期非常久，不建议需要短时间内发文章毕业的高年级博士。第三梯队：这一类别的杂志就很多了，Bio informatics曾经是最好的生信杂志，近几年因为文章数量太多灌水严重影响因子有所下降。Nucleic Acid Research也是专业的生信杂志。除了这些，Plod系列的Plod Genetics和Plod Computational Biology也都是接受生信文章的不错的杂志。Human Molecular Biology近几年也开始接受生信文章。第四梯队：如果被之前所有杂志都拒了，那基本上在国际上能够得到认可的杂志也就不多了。Explosion和BMC系列是最后选择了。‍‍

医学信息杂志是由国家新闻出版总署批准，中华人民共和国科学技术部主管，中华中医药学会中医容分会和陕西文博信息医学研究所主办的国家级信息医学及临床医学综合学术刊物, 中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊、中国期刊全文数据库收录期刊、中国期刊网、中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊、中文生物医学期刊文献数据库—CMCC收录期刊。面向全国征稿，国际刊号：ISSN1006-1959，国内刊号：CN61-1278/R，邮发代号：52-98，全国各大邮局均可订阅。国家级的一级期刊，万方数据库收录。官方投稿邮箱：

‍‍Bio informatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。2012年度IF=468 另外还有Briefings in Bio informatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+，2012年度IF=202。 稍次一点的杂志，如BMC Bio informatics，也是生物信息学的专刊。2012年度IF=447 对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。2012年度IF=215 除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。2012年度IF=276。PLOS Biology也是很好的杂志，2012年度IF=452。PLOS One也会经常有生物信息学文章，但被批灌水太多，算不得牛刊，2012年度IF=092。生物信息学相关的文章不一定要发到专门的生物信息学杂志，因为生物信息学作为一个工具，已经融入到很多生物问题的研究中，而不仅仅是一门孤立的学科了。‍‍

‍‍‍‍‍‍Bio informatics，很多方法类文章都发在上面，但是影响因子一般。如果有实验和数据分析，大多投到生物相关的杂志，比如genome research, nature genetics, nature等，在method里面涉及一些生信的方法，连带把algorithm放出来，供大家使用。所以，不一定非要发到Bio informatics。以前在Adderley学计算机的，研究字符串比较之类的问题，UNIX下的gnu diff就是他的杰作。后来写了blast，blast的重要性就不多说了，在后来在Celerity把string graph 应用到genome assembly，直接把HGP操翻。虽然现在因为2代测序出现D Bruising占了上风，不过随着3代测序的普及，他的string graph based OLC将再一次统治genome assembly界。‍‍‍‍‍‍

生物信息学PLoS计算生物学 BMC生物信息学三个比较有名的和专门的生物信息学期刊。一些知名的，但没有具体的生物信息学，只是很多bioinfo被发送到了上面。 核酸研究基因组生物学基因组研究 BMC基因组学 BMC系统生物学 BMC结构生物学蛋白结构，功能和生物信息学。 分子系统生物学片刻我能想到的也有几个。有很多不太出名的（影响因子）未列出