清华大学学生入学后,先在人文社会科学综合试验班(自2005年起为人文科学试验班)完成三个学期的人文学科的基础训练后,再进行历史学的学科专业训练。除各种公共课程之外,人文学科的基础训练,主要依托中西经典研读方面的课程(其中,“中国经典研读”和“西方经典研读”分别连续开设三个学期)和“文史哲学术入门”等课程来进行。在进入历史学科的专业训练之后,开设的主干课程有“先秦史”、“秦汉史”、“魏晋南北朝史”、“隋唐史”、“宋元史”、“明清史”、“晚清史”、“民国史”、“现当代中国史专题”、“世界上古中古史”、“世界近现代史”、“世界地区与国别史”、“历史文献学”、“历史文选”等。此外,学生应在第三学年结束时完成专业实践的训练环节,并于第四学年在相关领域教师的指导下,撰写本科毕业论文。