耿鉴庭先生应诊之余,于文史方面涉猎颇广。在目录学、训诂学、金石学、古器物学、文物考古方面均有相当研究。对扬州文献、文物的搜集、保护不遗余力。其中,尤对医药文献、医药文物更加注意,对中医古籍文献的整理也做出重要贡献。他以中医研究院创建时所集的中医古籍为基础,发起与北京图书馆协作,把全国60多家图书馆珍藏的中医书,编成全国第一部《全国中医图书联合目录》,作为国庆十周年献礼。特别是他在改革开放以后还主编了《广陵医籍丛刊》,遍收扬州医家及流寓扬州的外籍医家著作的各种刻本与稿本,在每项著作前都加入题跋及序,使扬州地方中医典籍的特点及成就得以宏扬,从而开中医地方典籍出版之先河,丰富了中医典籍的宝库。70年代末,经先生多方奔走,艰辛努力,在陈翰伯、王子野的支持下,成立了中医古籍出版社,先生任副社长兼总编辑,为中医古籍整理出版作了大量工作,从而使中医孤、善本的搜集整理编纂工作走上专业化、系统化的道路。