分子生态学的两个有力武器，一是分子生物学技术，用来解决生态学问题和现象；二是生态学思想，借助于分子生物学技术，在分子水平解决生命的基本现象。例子之一，利用分子标记方法（其实分子标记最早起源像是遗传学而不是分子生物学）去研究种群动态的机制。例子之二，为什么基因能够在一定程度上对生命事件起内因的决定作用，但并不能说起到全部的决定作用呢？比如癌症，一部分病因与环境（放射，微生物）有关，也与有关基因的微环境有关，例如，2005年6月的《自然》杂志电子版上发表了一篇文章，提出microRNA对干细胞的生长和癌细胞的快速增殖的重要作用。这是一个典型的分子生态整合的问题。应该说，非常多的学者重视分子生态学的前一个应用，即应用分子生物学技术去解决生态学问题，对用生态学思想去推进分子生物学发展却认识不深。生态学思想讲究的是物质世界的联系和问题的具体化，在很多方面重复性不是很高，分子生物学更重视一般性的、共同的学术思想，一般而言没有重复性是不可以的，这是它们的差异。但是，这种差异的产生是因为研究的问题具体化程度带来的。分子生物学被广泛应用于人类生活，或者说具体到某一个人时，就不得不用生态学的思想、观点和角度去重新认识一般性的理论了。分子生态学是一门具有活力的新兴学科,在解决野生动物的保护中潜力巨大。野生动物的保护目前仍然处于初级阶段,仅仅使用一些宏观保护策略和描述性的研究手段。而要理解野生动物进化灭绝的内在机理,掌握野生动物的遗传结构、基因变异以及保护和繁育濒危物种的分子与基因,分子生态学理论与技术将发挥不可估量的作用。利用分子标记研究野生动物的进化和繁衍、生物多样性的遗传机理以及濒危物种遗传物质与环境的关系,将对野生动物的保护产生深远意义。分子生态学现在是生态学向微观方向发展的一个新领域，用现代分子技术研究生态适应与生物进化的学科。并非分子生物技术在生态学领域的简单使用，而是多学科交叉的复合学科。 我简单地探讨一下分子生态学的原理：（1）生物的生化一致性和多样性原理：生化一致性表现在有相似的元素组成，相同的单体物件，相似的遗传，食物利用和能量转化功能等；生物多样性表现在化合物种类繁多、化合物的分子组成和结构变化大。在不同环境下的生命现象可能不同。（2）生物大分子进化速率恒定原理：“分子钟”假说，以年计时的生物大分子序列的改变速率大致保持恒定，或大分子序列之间的差异程度与其分岐进化的时间成正比；“分子钟”假说为追溯物种起源事件和类群分岐时间提供了理论基础。（3）表信息分子生态适应与生态进化原理：表信息分子是生化进化与适应的产物，是与代谢途径进化与适应相关联的；一处新的表信息分子的产生常伴随着一种新的酶促反应或代谢途径的出现。是基因型在分子水平上的表现型。是分子生态学研究的理论依据。最近通过文献检索发现，分子生态学（molecular ecology）杂志的影响因子在2003年为874，可见是一门很热门的交叉学科。主要研究手段是用分子标记、核酸指纹图谱、基因表达谱等分子手段研究生物进化、遗传和物种多样性、生物对环境变化的相应、转基因生物的环境释放等问题。
神之雪1314
