曾主持完成1项美国克罗恩病和溃疡性结肠炎基金会(Crohn’s Colitis Foundation of America, CCFA)科研项目、5项国家自然科学基金项目和教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-05-0609),目前承担有2项国家自然科学基金科研项目等科研课题,主要从事炎症性肠病患者免疫病理学损伤机制和临床疗效研究,多次在美国胃肠病大会(AGA)、欧洲胃肠病学大会(UEGW)和全国消化病学术大会上口头报告论文,在国内外同行领域有很大影响。近年来研究发现肠道炎症发生时免疫细胞调节异常,促炎症介质/抑制性介质失衡,miRNA表达异常,以及精神应激等因素相互作用引起肠道炎症损伤。通过常规的肠道局部免疫调节治疗,结合目前国际上最新的生物免疫靶向治疗、肠内外营养调理治疗等,有效控制克罗恩病和溃炎性结肠炎患者的病情发展,延缓手术干预,预防复发。已发表科研论文200余篇,其中SCI收录50余篇,代表性论文发表在Gut, Journal of Immunology, Inflammatory Bowel Diseases, Journal of Biological Chemstry等。参与国际IBD组织制定了克罗恩病合并瘘管的国际共识意见(论文发表在Gut, 2014)。