曾发表论文、著作百余篇。曾参加编写中国大百科全书医学部分等。1994年参加方圻教授主编的现代内科学编写,任编委,该书已获国家级二等奖。2003年主编“慢性肾功能衰竭—临床防治和理论基础”一书,由中国协和医科大学出版社出版。1952年在上海立二等功、1991年获国务院政府特殊津贴。1999年中央保健委员会授予荣誉证书。1996年,被中国科协评为为“中国科学技术协会先进工作者”。曾任中华医学会理事、名誉理事。是中华医学会肾脏病学会创始人之一,任第1届常委和2-4届副主任委员、曾任中华内科、中华老年杂志编委。现任国外医学泌尿系分册副主编,临床肾脏病杂志名誉主编,中华实用内科等杂志编委、美国Geriatric Nephrology and Urology(国际老年肾脏病杂志)编委。为北京老年医药卫生工作者协会知名专家委员会委员。2007年,中华肾脏病学会授予卓越贡献奖,2009年北京协和医院杰出贡献奖。毕增祺教授是我国肾脏病学奠基人之一(获得中华医学会肾脏病分会杰出贡献金奖),数十年如一日,工作在肾脏病防治的第一线,参与并指导协和医院肾脏内科的临床、教学、科研及高干保健工作。在我国,1986年,由国家直接指定成立了博士点,率先开展了慢性肾功能衰竭的非透析治疗,首先研制了必需氨基酸制剂和肾衰竭的营养疗法,探索了中西医结合在慢性肾衰非透析治疗中的意义;首批开展经皮肾活检,在我国最早报告了IgA肾病(中华内科1984年),开展了相差镜下尿红细胞形态的研究。近年来,对老年肾脏病做了一些研究。曾发表文章百余篇,主编“慢性肾功能衰竭防治和理论基础”。作为医学教育家,毕增祺教授于1986年被国务院首批直接授予为博士生导师,1991年获国务院政府特殊津贴。1996年,被中国科协评为为“中国科学技术协会先进工作者”。1999年中央保健委员会授予荣誉证书。曾任中华医学会理事、名誉理事,任第2—4届中华肾脏病学会常委和副主任委员兼秘书,曾任中华内科、中华老年杂志、中华肾脏病杂志编委,国外医学泌尿系分册副主编、中华实用内科等杂志编委、和美国GeriatricNephrologyandUrology杂志编委等。曾培养硕士、博士生多人,目前均已成为肾脏学界的中坚力量。