性质不同:商务印书馆是中国历史最悠久的现代出版机构。中国商务出版社是中华人民共和国商务部所属的中央级出版社,是集图书和期刊出版为一体的出版社。成立时间不同:商务印书馆於1897年在上海成立,初时以印刷业务为主,承揽商业簿记、帐本、广告印制,也承接教会圣经印刷,纯系一家印刷作坊。该社成立于1980年1月,原称“对外贸易出版社”,1983年4月更名为“中国对外经济贸易出版社”,2003年9月改为“中国商务出版社”。出版物不同:商务印书馆出版:一 、新式教科书,二、西学新著,三、中外文工具书,四、古籍整理,五、各式杂志。中国商务出版社出版发行国内外贸易和国际经济合作方面的著作、译著;国内外贸易和国际经济合作方面的文献、资料、统计、工具书以及有关的普及读物。影响力不同:商务印书馆是中国历史最悠久的现代出版机构,在近现代中国文化教育出版史上具有深远的影响。商务印书馆的创立,标志著中国现代出版事业的肇始 。中国商务出版社建社以来,以“立足外经贸,放眼全世界”为办社宗旨,坚持以“传播商务知识,促进经贸繁荣”为宗旨,为广大读者提供了更多更好的服务。经营性质不同:商务印书馆现隶属于新组建的中国出版集团,正以崭新的姿态迎接我国文化体制改革和出版体制创新的机遇和挑战。2012年,中国商务出版社转企改制,成为商务部唯一一家国有企业。