杨蕙馨 教授科研方面的主要成就表现在： 第一，产业组织理论与实证研究方面，尤其是关于企业进入退出及其相应的产业组织政策的研究。代表性成果是个人学术专著 《企业的进入退出与产业组织政策—以汽车制造业和耐用消费品制造业为例》 ， 2000 年由 上海三联书店、上海人民出版社列入 “ 当代经济学文库 ” 出版。此书出版后在经济理论界和经济工作部门引起很大反响，《光明日报》、《经济研究》、《中国工业经济》、《宏观经济研究》、《南开经济研究》、《中国经济时报》等纷纷发表评介文章，一些这个研究领域的专家学者认为，这部书从进入退出角度对中国产业组织进行了开创性的实证研究，其结论对于产业组织理论研究具有重要理论价值，对于中国产业组织优化和国有企业战略调整具有重要现实意义，填补了我国这一研究领域中的空白和缺陷。 这部书 2001 年分别获第九届孙冶方经济科学奖和山东省社会科学优秀成果一等奖， 2003 年获教育部普通高校第三届人文社会科学优秀成果二等奖。 这部书还被上海财经大学、南开大学、江西财经大学、山东大学、暨南大学、中南财经政法大学等高校产业经济学专业列为硕士生 和 博士生的主要参考阅读书；《经济研究》、《管理世界》等国内学术期刊相关研究论文也将此书作为主要引用文献和参考文献 。 第二， 产业关联的实证研究方面。主要代表性成果是发表在《管理世界》上的论文 《中国产业关联的实证分析与产业政策》。 中国社会科学院江小涓在《中国社会科学》上发表的论文《理论、实践、借鉴与中国经济学的发展—以产业结构理论研究为例》，认为这篇论文是 20 世纪 90 年代以来利用投入产出表对中国产业结构和产业关联进行计量经济研究的代表性成果（见 1999 年第 6 期）。中国社会科学院经济研究所前所长张卓元主编的《论争与发展 : 中国经济理论 50 年》（云南人民出版社1999 年）一书中，将本文列为“ 90 年代尝试用比较符合西方学术规范的方法对中国产业的关联度进行实证分析”的代表作（参见“产业结构与产业组织理论”一章， 466-503 ）。 第三 ，企业组织理论方面的研究。代表性成果有 《从技术角度对企业内部组织演进的考察》 （《文史哲》 2003 年第 3 期）、 《技术变迁与企业组织演进》 （《外国经济与管理》 2002 年第 10 期）。
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