中国社会科学院台湾研究所成立以来，承担完成了中央和有关部门委托的大量重要研究课题，并提供了大量有参考价值的综合分析报告；参与了《台湾问题与中国统一》（白皮书）、《一个中国的原则与台湾问题》（白皮书）以及有关重要对台文件、领导人讲话的起草；承担了多项国家社科基金、国家自然科学基金等委托的重大研究课题或特别项目。台湾研究所编辑出版的《台湾总览》、《台湾经济总览》、《当代台湾人物大辞典》、《海峡两岸经贸投资大全》、《台湾机构、社团、企业大全》、《中国国民党全书》、《答台湾同胞问》、《台湾知识问答》等工具书和台湾问题知识读物，对大陆台湾研究和涉台宣传教育起了开拓性的作用。同时，台湾研究所还完成了一大批学术著作，包括《海峡两岸关系概论》、《一国两制与台湾前途》、《台湾问题的由来与发展》、《转型期的台湾》、《两岸经贸关系探讨》、《台湾问题实录》、《民进党执政状况研究》、《民进党政商关系研究》、《民进党大陆政策研究》等，参与编撰的《中国台湾问题》（干部读本）、《中国台湾问题》（大学生读本）、《台湾问题读本》（中共中央党校教材）、《中国台湾问题外事人员读本》等涉台教材具有广泛影响。台湾研究所研究人员每年以个人或合作名义撰写了近百篇有关海峡两岸关系和平统一以及台湾政治、经济、社会、文化、历史等方面的学术论文，对繁荣祖国大陆的对台学术研究发挥了积极作用。
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