学校坚持科教兴校战略,重视科教研活动,鼓励教师从辅导型向专家型转变,从学习型向研究型转变。全校90%以上教师参与了实验课题研究,30%的教师有自己主持实验的课题。现有省级以上实验基地4个。近几年,共承担49项课题研究任务,其中国家级列项课题4项,省级2项,台州市28项,临海市15项。现已结题36个,其中15个课题被评为优秀课题。全校教师有500多篇教育教学论文在市级以上论文评比中获奖或发表,其中200多篇教育教学论文在《现代中小学管理》、《现代教育科学》、《中小学教师培训》等正规刊物或书刊上发表。学校连续几年被评为台州市、临海市教育科研先进集体。学校教学质量远近闻名,始终坚持以质量求生存,以改革求发展,向40分钟要质量的办学宗旨。学校实施了集体备课、分层教学、分层作业、信息化教学等课堂改革。为了切实减轻学生课业负担,学校对家庭作业进行了改革,每天下午第三节定为作业整理课,得到了广大学生和家长的欢迎。近几年,学生毕业考试、中学入学考试、外国语学校入学面试成绩均名列全市前茅。巾山小学毕业生的学习质量得到了中学老师的一致肯定。