2002年至2009年7月，该所获得国家和省部级科研成果奖励20项，其中国家二等奖3项，第一完成单位1项；省部级一等奖7项，第一完成单位5项。具有代表性的成果有：“持久性有机污染生物有效性研究”获得2003年广东省科学了技术一等奖，并于2006年获得国家自然科学二等奖，傅家谟院士由于在有机地球化学和环境科学领域中做出的突出贡献，被授予首届“广东省科学技术突出贡献奖”。2006年至2008年，全所共发表学术论文1467篇，其中SCI收录的国际刊物论文439篇、SCI收录的中国刊物论文120篇、中国核心刊物及统计源刊物论文908篇，出版专著22种。 中国科学院广州地球化学研究所主办有地学核心刊物《地球化学》和《大地构造与成矿学》。 《地球化学》 《地球化学》是由中国科学院广州地球化学研究所、中国矿物岩石地球化学学会主办的专业学术刊物，主要报道近代地球化学，特别是其主要分支学科，如同位素地球化学、同位素地质年代学、矿床地球化学、有机地球化学、元素地球化学、环境地球化学、宇宙化学、海洋地球化学、实验地球化学、第四纪地球化学、构造地球化学及岩矿测试等方面的创造性、综合性科研成果和研究简报、书刊简介、会议简讯、最新地质科技信息研究动态和问题讨论等，是《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》、皇家化学学会系统列文摘、《化学文摘（网络版）》、中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）、中国科学引文数据库、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊收录期刊。 《大地构造与成矿学》 《大地构造与成矿学》是由中国科学院主管、中国科学院广州地球化学研究所主办、科学出版社出版的地质学类中文核心期刊。该刊由中国已故地质学家、大地构造学家、中国科学院资深院士陈国达先生于1977年创办（创刊名为《成矿研究》，1979年改为现刊名），1984年起公开发行，1989年起由科学出版社出版。该刊以构造地质学和成矿学为其学术特色，系中国唯一一份重点刊载构造地质学学术论文的科技期刊。刊登内容涉及构造地质学、大地构造学、成矿学、岩石矿物与地球化学、地球动力学、大陆边缘地质和石油地质等多个学科和领域，该刊相对固定的栏目主要是：构造地质学研究、构造地质与成矿学研究、岩石大地构造与地球化学研究。该刊2006年、2007年、2008年、2009年的影响因子分别为75、92、677和906，前3年分列中国地学科技期刊第10位、第6位和第8位（暂缺2009年排位数据）。该刊平均引文数、基金项目论文比率在广东省科技期刊中分列第2位和16位，期刊影响因子与该学科平均影响因子之比为838，位列广东省科技期刊第7位。该刊已连续3次入选2000年版、2004年版和2008年版《中文核心期刊要目总览》，已经成为中国中文核心期刊地球科学类的重要期刊之一。除国内的全部重点数据库与检索系统之外，该刊还先后入选美国《EI》、《CA》、俄罗斯《文摘杂志》、日本《科学技术文献速报》等国际检索系统。1998年、2000年分别荣获湖南省和中国科学院优秀科技期刊称号。
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