《新疆人文地理》无论是板块设置还是出版形式，都与时下流行的《中国国家地理》、《华夏地理》、《国家人文地理》以及美国的《国家地理》接近，但内容重点突出的是新疆独特的人文地理及新疆的地域文化，甚至连封面上框的颜色也是有讲究的。如美国《国家地理》几十年来一直是黄框；《中国国家地理》是红框，体现中国风格；《西藏人文地理》是紫金色框，体现的是藏传佛教的颜色；而《新疆人文地理》的边框是蓝色，这是穆斯林群众喜爱的颜色，体现的是当地的民族文化特色。《新疆人文地理》确定的内容板块包含12个方面：历史文化、非物质文化遗产、地理发现、自然奇观、科学考察、考古探险、生态环境保护、摄影活动、旅游景点推介、珍稀动物保护、民俗风情展示、户外活动推广及中亚旅游等。读者定位基本确定为热爱新疆、热爱自然、关注环境、具有人文情怀的旅游者，从事科学研究考察的专业人员，政府公职人员，摄影爱好者，户外爱好者及有一定收入的白领阶层。 为了办好《新疆人文地理》，杂志社特别邀请了10多位历史、文化、地理方面的专家，如中国社会科学院研究员、绿洲文化研究和新疆探险方面的专家扬镰，地理专家夏训诚，新闻专家黄元才，考古专家伊弟利斯·阿不都热苏勒，生态学专家胡文康，历史学专家苗普生和旅游专家毕亚丁等，共同商讨策划有特色的栏目，最终确定了《特别策划》、《丝路密码》、《西地影像》、《科考发现》、《人与自然》、《生态视觉》、《考古探险》、《地理景观》、《户外天堂》、《中国和田玉》等10多个栏目。
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