林木育种论文

参加工作已来，，已发表论文37篇，其中16篇为SCI收录论文。参与王明庥院士主编的《林木遗传育种》一书的撰写，该书获国家科委优秀科技图书一等奖。文章发表在Science、Nature、Plant Journal、New Phytologist、Plant Physiology、Genome Research、Heredity、Tree Genetics & Genomes、PloS ONE、遗传、Molecular Breeding等国际国内主流期刊 。 Ye, Qiaolin Ye, Ning; Yin, Tongming : Enhanced multi-weight vector projection support vector machine ,Pattern Recognition Letters, v 42, n 1, p 91-100, June 1, 2014 Neighbors' distribution property and sample reduction for support vector machines, APPLIED SOFT COMPUTING,2014,V16:201-209 Boundary detection and sample reduction for one-class Support Vector Machines,NEUROCOMPUTING, V123:166-173 Muchero, W, M M Sewell, et (2013) Genome Anchored QTLs for Biomass Productivity in Hybrid Populus Grown under Contrasting E PLoS One 8(1) Li, S, T Shi, et (2013) Methods for breaking the dormancy of eastern redbud (Cercis canadensis) Seed Science and Technology 41(1): 27- Wan, Z B, Y R Li, et (2013) Melampsora larici-populina, the main rust pathogen, causes loss in biomass production of black cottonwood plantations in the south of C Phytoparasitica 41(3): 337- Liu, J J, T M Yin, et (2013) Transcriptome Analysis of the Differentially Expressed Genes in the Male and Female Shrub Willows (Salix suchowensis) PLoS One 8(4) Marker-aided selection 1 of polyploid poplars Bioenergy Res，EI SCI 2013 Discovey and experimental analysis of microsatellites in an oil woody plant Cameallia Plant Syst Evol,correspondence SCI 2013 Identification of quantitative trait loci and candidate genes for cadmium tolerance in Populus TREE PHYSIOLOGY SCI 2012, 32 (5): 626-638 The obscure events contributing to the evolution of an incipient sex chromosome in Populus: a retrospective working hypothesis Tree Genetics & Genomes SCI (2012) 8:559–571 Genome-wide detection of genetic loci triggering uneven descending of gametes from a natural hybrid pine Tree Genetics & Genomes，通讯 SCI 2012,DOI 1007/s11295-012-0524-5 基于Otsu算法的木材缺陷图像分割 计算机与数字工程 2012,276: 116-118 杨树锈菌表达序列微卫星分析及EST-SSR标记开发 东北林业大学学报 2012,40:76-80 油茶基因组微卫星特征分析 南京林业大学学报 2012,36:47-50 环境条件和播后覆土对水杉种子出苗率的影响 中南林业科技大学学报 2012,32:26-30 林木遗传育种基础研究热点述评，林业科学，2012,48:150-154 林业科学 2012,48:150-154 基于改进的Affinity Propagation聚类的木材缺陷识别 工 程 数 学 学 报 2012， 49：600-606 Establish the ideal statistical model tracking the Dynamic growth rhythm for progeny in a full-sib family of Salix xuzhouenesis 4th International Conference on Pulping, Papermaking and Biotechnology, ISTP 2012,Nanjing China DETECTION AND FUNCTIONAL ANALYSES OF MICROSATELLITES IN CODING SEQUENCES OF PINES 4th International Conference on Pulping, Papermaking and Biotechnology, ISTP 2012,Nanjing China Yin, T, X Zhang, et (2010) Differential detection of genetic Loci underlying stem and root lignin content in P PLoS One 5(11): Li, S, Y Chen, et (2010)Potential chromosomal introgression barriers revealed by linkage analysis in a hybrid of Pinus massoniana and P BMC Plant Biol 10: Compare gene densities between chromosomes that share large duplicated segments and survey gene coverage by ESTs in polar Genomics and applied biology 通讯作者 2010，29(3) 桉树EST序列中微卫星含量及相关特征分析 植物学报通讯作者 国内 2010，45（3） Characterization of microsatellites in the coding regions of the Populus genome Molecular Breeding通讯作者 SCI DOI: 1007/s11032-010-9413-5 Bioinformatics-Based Identification of Candidate Genes from QTLs Associated with Cell Wall Traits in Populus Bioenergy Res SCI 2010，DOI 1007/s12155-009-9060-z Characteristics of microsatellites in the transcript sequences of the Laccaria bicolor genome Journal of Microbiology and Applied Biotechnology通讯作者 SCI 2010, 20（3） 林木基因组和功能基因克隆研究进展与展望 遗传 国内 2010, 32(7) An Improved Approach for Mapping Quantitative Trait Loci in a Pseudo-Testcross: Revisiting a Poplar Mapping S Bioinformatics and Biology Insights 国外 SCI 2010:4 BoxCox转换对数量性状基因座位分析的影响及其应用 南京林业大学学报 国内 2010，34（3） 黄山松不同生理生化指标随海拔高度变化趋势研究 东北林业大学学报通讯作者 国内 2010,38（6） Microsatellite primers resource developed from the mapped sequence scaffolds of Nisqually-1 genome New Phytologist SCI 2009, 181 A microarray-based genotyping and genetic mapping approach for highly heterozygous outcrossing species enables localization of a large fraction of the unassembled Populus trichocarpa genome sequence Plant Journal SCI (2009) 58 Detection of quantitative trait loci influencing growth trajectories of adventitious roots in Populus using functional mapping Tree Genetics & Genomes 国外 SCI (2009) 5 A genetic linkage map for the ectomycorrhizal fungus New Phytologist 国外 SCI (2008) 180 Comparative Analysis of F-Box Proteins in Arabidopsis, Poplar and Rice Suggests Differential Proteolytic Pathway Mediated through F-Box Protein between Woody Perennial and Herbaceous Annual Plants Plant Physiology SCI 2008,148 Genome structure and emerging evidence of an incipient sex chromosome in Populus Genome Research SCI 18: 422-430, A physical map of the highly heterozygous Populus genome: integration with the genome sequence and genetic map Plant Journal SCI 50(6):1063-78, 2007 A dense linkage map of hybrid cottonwood (Populus fremontii_P angustifolia) contributes to long-term ecological research and comparison mapping in a model forest tree Heredity SCI (2008) 100 Map and Analysis of Microsatellites in Genome of Populus: the First Sequenced Perennial Plant SCIENCE IN CHINA SERIES C-LIFE SCIENCES通讯作者 SCI 50(5), 690-699, 2007 植物细胞壁伸展蛋白研究述评 林业科学，通讯作者 国内 2010，46：144-152 The Bioenergy Science Center (BESC) and Overcoming Recalcitrance of Populus to Biofuel P IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY-ANIMAL 国外 SCI 2010, 46:48 - 杨树微卫星序列对基因表达频率影响及表达序列中微卫星特征分析 南京林业大学学报，通讯 国内 2011，35:11-14 松树、杨树及桉树表达基因序列微卫星比对分析 基因组与应用生物学，通讯作者 国内 2011，30：103-109 The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (T & Gray ex Brayshaw) SCIENCE 国外 SCI 313: 1596-1604, 2006- The genome sequence of the basidiomycete fungus Laccaria bicolor provides insightsinto the mycorrhizal symbiosis Nature SCI 452:88-93, 2008 - Phenotypic variation in growth and biomass distribution for two advanced-generation pedigrees of hybrid poplar(Populus ) CANADIAN JOURNAL OF FOREST RESEARCH 国外 SCI 35 (8): 1779-1789 AUG,2005 Mapping the Rust Resistant Loci MXC3 and MER in P trichocarpa and Assessing the Intermarker Linkage Disequilibrium in MXC3 Region NEW PHYTOLOGIST 国外 SCI 164 (1): 95-105 OCT 2004 Large-scale Heterospecific Segregation Distortion in Populus Revealed by a dense Genetic Map THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 国外 SCI 109 (3): 451-463 AUG 2004 Characterization of Microsatellites Revealed by Genomic Sequencing of Populus trichocarpa CAN J FOR RES SCI 34(1): 85-93 (2004) A likelihood approach for mapping growth trajectories using dominant markers in a phase-unknown full-sib family THEOR APPL GENET 国外 SCI 108 (4): 699-705 FEB2004 马尾松表达序列标签多态性初步分析 林业科学 40(6):176- Nov 2004 Nearly complete genetic maps of Pinus sylvestris L (Scots pine) constructed by AFLP marker analysis in a full-sib family THEOR APPL GENET 国外 SCI 106 (6): 1075-1083 APR 2003 利用分子标记技术对林木近缘种进行遗传鉴别的研究 林业科学 国内 39(3): 130-135, 2003 Analysis of genetic structure of natural populations of Castanopsis fargesii by RAPDs ACTA BOT SIN 国内 SCI 44 (11): 1321- 1326 NOV 2002 Molecular linkage maps of the Populus genome GENOME 国外 SCI 45 (3): 541-555 JUN 2002 Preliminary interspecific genetic maps of the Populus genome constructed from RAPD markers GENOME 国外 SCI 44 (4): 602-609 AUG 2001 Host effect on genetic variation of Marssonina brunnea pathogenic to poplars THEOR APPL GENET 国外 SCI 100 (3-4): 614-620 FEB 2000 History and progress of the genomics studies in the model system of perennial plant species ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA 国内 SCI 42 (5): 464-479 SEP 2004 Quantitative trait loci for growth trajectories in Populus GENET RES 国外 SCI 81 (1): 51-64 FEB 2003 A logistic mixture model for characterizing genetic determinants causing differentiation in growth trajectories GENET RES 国外 SCI 79 (3): 235-245 JUN 2002 用SSR研究栲树群体遗传结构 植物学报 国内 SCI 43（4）：409-412，2001

林木遗传育种、林木培育、森林经营、经济林、水土保持、园林绿化与设计、森林资源及其保护、木材学及木材工业、林产化工、林业机械、林业经济等学科和有关基础理论学科方面的学术论文、研究报告、文献综述、试验简报、学术动态及林业新书简介等。

人工种子(artificial seed) 是人为制造的种子，它是一种含有植物胚状体或芽、营养成分、激素以及其他成分的人工胶囊。植物组织培养可以诱导植物组织产生胚状体，这种结构与来自正常有性生殖的合子胚十分相似。将胚状体包裹在含有营养成分和保护功能的膜内，就可以做成人工种子，在适宜条件下，这种人工种子与天然种子一样，可以发芽出苗。人工种子是在植物的快速繁殖技术上发展起来的，它的主要优点是：繁殖速度很快，可以用发酵罐大量生产，生产成本比试管苗低，且体积小，易于运输等。人工种子的前景十分诱人。 ------------------------------------------------ 人工种子（artificial seeds，synthetic seeds）的概念最早是由Murashige(1978)提出的，是指通过组织培养技术，将植物的体细胞诱导成在形态上和生理上均与合子胚相似的体细胞胚，然后将它包埋于有一定营养成分和保护功能的介质中，组成便于播种的类似种子的单位。人工种子首先应该具备一个发育良好的体细胞胚（即具有能够发育成完整植株能力的胚）；为了使胚能够存在并发芽，需要有人工胚乳，内含胚状体健康发芽时所需的营养成分、防病虫物质、植物激素；还需要能起保护作用以保护水分不致丧失和防止外部物理冲击的人工种皮。通过人工的方法把以上3个部分组装起来，便创造出一种与天然种子相类似的结构——人工种子。 由于人工种子是通过无性繁殖产生的，与天然种子相较，人工种子可以工厂化生产和贮存；可以减少具有杂种一代优势的作物的育种程序；可以快速繁殖结实率低或难以用种子繁殖、育性欠佳的作物；可以快速推广优良种质资源；人工种子还具有节约种源、土地，不受季节限制的优点。因此，受到许多国家的重视，我国已将人工种子的研究列入了863高新技术发展计划。Kitto等（1981）用聚氧乙烯包裹胡萝卜胚状体首次制成了人工种子。经过20余年的研究，人工种子的研究取得了很大进展，除了胡萝卜、苜蓿、芹菜、水稻、玉米、甘薯、棉花、西洋参、小麦、烟草、大麦、油菜、百合、莴苣、马铃薯等农作物种子外，花卉和林木人工种子如长寿花、水塔花、白云杉、黄连、刺五加、橡胶树、柑桔、云杉、檀香、黑云杉、桑树、杨树等都有成功生产的报道。 人工种子的制备方法与技术要求 人工种子制备包括胚状体的诱导与同步化、人工种子的包埋、人工胚乳的制作、人工种皮的制作、人工种子贮藏等步骤内容。 1 胚状体的诱导与同步化 生产高质量的胚状体是制作人工种子的关键。从目前的研究结果来看，并不是所有的植物种子都开发出了胚状体培养发生技术。不同植物的体细胞的培养亦有难易。在生产人工种子时，要求胚状体具有可观的成株率，甚至超过天然种子。 胚状体的诱导：胚状体可从悬浮培养的单细胞得到，也可通过试管培养的愈伤组织、花粉或胚囊获得。胚状体一般在培养物的表面产生，其形状与合子胚类似，但胚状体却是无性繁殖的产物。实际操作中，一般在试管中诱导出愈伤组织，并在含生长素的培养液中悬浮培养，然后置于含生长素的发酵罐中，使细胞迅速扩增，再将细胞移入无生长素的发酵罐中诱导出大量胚状体。 胚状体同步化处理或分选：胚状体的同步化是指促使所有培养的细胞或发育中的细胞团块进入同一个分裂时期。只有同步化了细胞才可能成批地产出成熟胚胎。常用的方法有： 化学方法：饥饿法——将培养基中的一些重要成分反复去除和添加；阻断法——在培养初期加如DNA合成抑制剂，如5-氨基脲嘧啶，阻断细胞分裂的G1期。 物理方法：低温处理法、过滤筛选法、渗透压分离法、密度梯度离心法(体胚不同的发育阶段密度有差异)等到胚状体胎成熟以后，就可以进行人工种子的包埋了。其中过滤筛选法较实用、快速。 2 人工种子的包埋 人工种子的包埋关系到人工种子萌发、贮藏和生产应用等重要环节。Redenbaugh于1984年首次筛选出透水性好的海藻酸钠作为胚状体和不定芽的包埋剂。包埋方法主要有将胚状体或小植株悬浮在一种粘滞的流体胶中直接播入土壤的液胶包埋法；将体细胞胚经干燥后用聚氧乙烯等聚合物进行包埋的干燥包裹法；以及通过离子交换或温度突变形成凝胶包裹材料的水凝胶法，Redenbaugh等用此法包裹单个苜蓿体细胞胚制成了人工种子，离体成株率达86%。组合包埋法以及流体播种、液胶包埋、琼脂、铝胶囊等新颖包埋法也开始被应用，George等用硅胶包埋谷子体细胞胚，葫发率达82%，且4℃贮藏14天后仍能自行裂开、顺利萌发。 对胚状体包裹要求做到：首先，不影响胚状体萌发，并提供其萌发与成苗所需的养分和能量，即起到胚乳的作用；其次，使胚状体经得起生产、贮存、运输及种植过程中的碰撞，并利于播种，即起到种皮的保护作用；最后，针对植物种类和土壤等条件，满足对人工种子的特殊需要。 目前研究中的人工种子普遍采用水凝胶法，以海藻酸钙作为包埋剂，它具有对胚状体无毒害作用、价格低廉等优点。但由于海藻酸钙对水溶剂有很好的通透性，使得包埋其中的营养物质、激素、抗生素等(即人工胚乳成分) 容易渗透出来，造成营养泄露；另外，由于没有真正意义上的“人工种皮”的包裹保护，一些病原微生物容易侵入胚状体，对种子造成破坏，因而目前绝大多数人工种子都只能在无菌条件下才能达到较高萌发率。 3 人工胚乳的制作 为了满足包裹要求，要有针对性地在包裹剂中加入大量养分、无机盐、有机碳源、植物生长调节剂，以及抗菌素和有益菌类。选用无毒、透气和吸水性强的木薯淀粉与5%海藻酸钠(1/2MS培养基配制)混合制作的胚乳可改善单一海藻酸钠人工胚乳的透气性、吸水性和发芽率，人工胚乳中加入GA3有利于人工种子的发芽，加入CaCl2有利于向培养物供氧，提高人工种子发芽率和耐贮藏性，加扩活性炭可改善营养固定和缓释，提高人工种子在土壤中的成苗率。 4 人工种皮的制作 人工种皮既要求允许内外气体交换畅通，以保持胚状体的活力，又要能防止水分及营养成分的渗漏和起保护作用。一般采取双层种皮结构，内种皮通透性较高，外种皮硬，透性小，起保护作用。 现已筛选出海藻酸钠、明胶、果胶酸钠、琼脂、树胶等可作内种皮应用，某些纤维素衍生物与海藻酸钠制成复合改性的包埋基质可明显改善人工种皮的透气性，海藻酸钠中加入多糖、树胶等可减慢凝胶的脱水速度，提高干化体细胞胚的活力。 外层种皮可选用半疏水性聚合膜，以降低海藻酸钙的亲水性，对人工胚乳起固定作用。另外可在膜上添加毒性小的防腐剂或溶菌酶，以防止微生物的侵入。Ling-FongTay用壳聚糖作为外种皮制作的油菜人工种子萌发率达100%，但在有菌条件下萌发率仍不高。美国杜邦公司生产的由乙烯、乙酸和丙烯酸三种物质聚合的Elvax材料是目前认为较好的一种人工种皮材料。 人们仍在积极寻找其他的包埋方式和包埋材料，以完善现有人工种皮的制作技术。 5 人工种子的贮藏 贮藏是人工种子的主要难点之一，目前应用的有低温法、干燥法、抑制法、液体石蜡法等及上述方法的组合。干燥法和低温法组合是目前应用最多的，胡萝卜愈伤组织在15℃相对湿度25%的条件下存放一年仍可再生。大豆体胚干化到原体积的40%～50%后再吸水，萌发率仍达到31%。干化增强人工种子幼苗的活力，可能与其超氧化物酶和过氧化物酶的活性显著提高，从而减轻低温贮藏对体胚的伤害有关。通过电镜观察和电导值与脱氢酶的比较，发现干化有助于体胚贮藏期间细胞结构、膜系统的保持和酶活性的提高，使体胚具有更好的耐贮性。富含胡萝卜体胚的悬浮培养液包埋于水溶性塑料薄膜内，形成的胶囊26℃干化4天后再吸水萌发仍可获得植株，高浓度的蔗糖、脯氨酸和ABA预处理体胚能提高干化耐受性，这可能与ABA等抑制体胚过早萌发、促进干物质积累有关。近年，液氮冻存体胚及包裹体胚的报道也越较多。 防腐是人工种子贮藏和大面积田间应用的关键技术之一。Castillo制得的人工种子虽有较高的萌发率，但未能在有菌条件下成苗，其主要原因是人工种子易感染病菌而腐烂。在甘薯人工种皮中加400～500mg/L的先锋霉素、多菌灵、安苄青霉素或羟基苯酸丙酯，均有不同程度的抑菌作用，萌发率可提高4%～10%。 人工种子技术存在的主要问题 尽管目前人工种子技术的实验室研究工作已取得较大进展，并且已在繁殖遗传工程植物、减数分裂不稳定植物、稀有及珍贵植物的过程中，显示出超常的优势。但从总体来看，目前的人工种子还远不能像天然种子那样方便、实用和稳定。主要障碍在于人工种子的质量和成本：(1)许多重要的植物目前还不能靠组织培养快速产生大量的、出苗整齐一致的、高质量的胚状体或不定芽；人工种子的质量达不到植物正常生长、运输和贮藏的要求；人工种子的制种和播种技术尚需进一步研究。(2)目前多数人工种子的成本仍然高于试管苗和天然种子。虽然一些研究机构已经建立起大规模自动化生产线，能够生产出高质量、大小一致、发育同步的人工种子，但是它的成本仍高于天然种子。以苜蓿为例，目前生产1粒人工种子所需成本是026美分，而1粒天然苜蓿种子的成本是0006美分，二者相差40多倍。因此，人工种子要真正进入商业市场并与自然种子竞争，必须降低生产成本。由于人工种子是由组织培养产生的，需要一定时间才能很好地适应外界环境，因此人工种子在播种到长成自养植株之前的管理也非常重要，在推广之前必须经过农业试验，并对栽培技术及农艺性状进行研究。 由此可见，人工种子要想成为种植业的主导繁殖体，目前仍有相当的困难。 人工种子在园林绿化及水土保持方面的应用前景 人工种子与试管苗相比，具有所用培养基量少、体积小、繁殖快、发芽成苗快、运输及保存方便的特点；人工种子技术适用于难以保存的种质资源、遗传性状不稳定或育性不佳的珍稀林木的繁殖；人工种子可以克服营养繁殖造成的病毒积累，可以快速繁殖脱毒苗。因此，人工种子在快速繁殖苗木和人工造林方面，具有很大的应用前景。现在，我国处于经济高速发展时期，需要有大量的优良苗木种子供应，而我国现有的林木种子供应远远不能满足社会需求。人工种子可以工厂化地提供绿化种子，解决种子供应量不足的矛盾。随着人工种子技术的不断成熟完善，必将给我国的园林绿化方式带来革命性的变化

非常好找，而且是很好的单位。因为从国家十一五以来，国家大力支持动植物遗传育种项目，好多单位都需要水平高的遗传育种科研人才。如果你同时具备数量遗传学和分子生物学背景那就更好找了；如果你博士毕业同时具备较高的高等数学，数量遗传学，分子生物学，那就非常抢手了。这个需要你在读博期间通过发表的SCI论文的数量和质量（影响因子）来体现的。当然，即使水平一般的遗传育种专业的博士，也不用担心工作，绝对没有问题。