因为一个细胞群体是异质的。比如你想看肿瘤的基因表达状态，想测它的mRNA，看表达谱。问题是，一大坨肿瘤细胞里，不见得都有相同的基因变异，而且不太可能都处于相同的状态（细胞周期等）。那么用传统方法去测，弄一大堆数据出来，只能代表这些细胞的“平均”状态，一些比较有个性、但又比较重要的状态就会被抹平。事实上，现在单细胞测序也有高通量的技术了 DROP-seq。搞上万个细胞不是问题。但是single cell的noise model很麻烦 capture efficiency也不高，得到数据之后怎么去噪，怎么降维聚类就成了关键问题。现在研究的前沿已经转向这类问题了。这里有个整理过的reading list 可以看看里面的文献： single cell RNA-seq
盖碗茶136
