上海教育出版社，下包括：社长室、总编办公室、以及各个编辑部门，如政治教育编辑室、《素质教育大参考》编辑部、教育编辑室、文科第一编辑室、文科第二编辑室、《语言文字周报》编辑部、美术编辑室、幼儿读物编辑室、《看图说话》编辑部、数学编辑室、《小学数学教师》编辑部、理科第一编辑室、理科第二编辑室、外语编辑室、综合第一编辑室、综合第二编辑室、高等教育编辑室、《语文学习》编辑部、《小学语文教师》编辑部、音乐图书出版中心（筹）、装帧设计室。并有业务部门、市场部、教材教辅开发部、出版科、校对科、财务科、行政科、人事科。
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