微生物学报，微生物学通报（中科院）Journal of Bacteriol (JB)Microbiology Molecular Microbiology PLOS Pathogens
常用的期刊有微生物学报，工业微生物，生物催化学报，生物加工过程等，pubmed和生物秀都是较好的生物医学网站，小木虫上也可以进行文献检索，此外各大院校的数据库也可以进行文献检索。
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JCR微生物学三区的期刊有34种，如Advances in microbial Physiology、Current topics in Microbiology and Immunology、Frontiers in Cellular and Infection Microbiology（最新为2015年，见下表），2015年影响因子IF
还有遗传学报(J GENET GENOMICS)也是发展迅猛，影响因子从去年的上升至，这份期刊由中国遗传学会，中国科学院遗传与发育生物学研究所主办，主要刊载动物、植物、医学和微生物等遗传学领域的研究论文，
《微生物学报》、《生物工程学报》、《病毒学报》、《中国人兽共患病学报》、《中国病毒学》、《微生物学通报》、《微生物学杂志》
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