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Bio informatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。2012年度IF=468 另外还有Briefings in Bio informatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+，2012年度IF=202。 稍次一点的杂志，如BMC Bio informatics，也是生物信息学的专刊。2012年度IF=447 对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。2012年度IF=215 除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。2012年度IF=276。PLOS Biology也是很好的杂志，2012年度IF=452。PLOS One也会经常有生物信息学文章，但被批灌水太多，算不得牛刊，2012年度IF=092。生物信息学相关的文章不一定要发到专门的生物信息学杂志，因为生物信息学作为一个工具，已经融入到很多生物问题的研究中，而不仅仅是一门孤立的学科了。
Bio informatics，很多方法类文章都发在上面，但是影响因子一般。如果有实验和数据分析，大多投到生物相关的杂志，比如genome research, nature genetics, nature等，在method里面涉及一些生信的方法，连带把algorithm放出来，供大家使用。所以，不一定非要发到Bio informatics。以前在Adderley学计算机的，研究字符串比较之类的问题，UNIX下的gnu diff就是他的杰作。后来写了blast，blast的重要性就不多说了，在后来在Celerity把string graph 应用到genome assembly，直接把HGP操翻。虽然现在因为2代测序出现D Bruising占了上风，不过随着3代测序的普及，他的string graph based OLC将再一次统治genome assembly界。
一、北京大学图书馆“中文核心期刊” 二、南京大学“中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊” 三、中国科学技术信息研究所“中国科技论文统计源期刊”（又称“中国科技核心期刊”） 四、中国科学院文献情报中心“中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊” 五、中国人文社会科学学报学会“中国人文社科学报核心期刊” 六、中国社会科学院文献信息中心“中国人文社会科学核心期刊” 七、万方数据股份有限公司建设的“中国核心期刊遴选数据库”——中国期刊库
最著名的是电子学报。
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最著名的是电子学报。
一、北京大学图书馆“中文核心期刊” 二、南京大学“中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊” 三、中国科学技术信息研究所“中国科技论文统计源期刊”（又称“中国科技核心期刊”） 四、中国科学院文献情报中心“中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊” 五、中国人文社会科学学报学会“中国人文社科学报核心期刊” 六、中国社会科学院文献信息中心“中国人文社会科学核心期刊” 七、万方数据股份有限公司建设的“中国核心期刊遴选数据库”——中国期刊库
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1、北京大学图书馆“中文核心期刊”。2、南京大学“中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊”。3、中国科学技术信息研究所“中国科技论文统计源期刊”（又称“中国科技核心期刊”）。4、中国科学院文献情报中心“中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊”。5、中国人文社会科学学报学会“中国人文社科学报核心期刊” 。6、中国社会科学院文献信息中心“中国人文社会科学核心期刊”。7、万方数据股份有限公司建设的“中国核心期刊遴选数据库”——中国期刊库。核心期刊是某学科的主要期刊。一般是指所含专业情报信息量大，质量高，能够代表专业学科发展水平并受到本学科读者重视的专业期刊。双核心期刊：如果该期刊被同时被两种核心期刊遴选体系认定为核心，那么该期刊就是双核心期刊了。比如，既入选“全国中文核心期刊”，又入选《中国人文社会科学核心期刊》。双核心期刊与单核心期刊在职称评选中，均为核心期刊。但双核心期刊的学术水准自然要更好一些。因为在国内对于中国核心期刊的认知并不是完全一致的，而是分成了不同的体系。各个体系都是有着自己的考量标准的。在这七大体系中最常用的有三种，分别是北大核心、南大核心和中国科学引文数据库。
目前国内认可的国外期刊数据库有 SSCI, SCI,EI SSCI[1]即社会科学引文索引，SCI的姊妹篇，亦由美国科学信息研究所创建，是目前世界上可以用来对不同国家和地区的社会科学论文的数量进行统计分析的大型检索工具，是世界最重要的社会科学期刊索引。 SCI(Science Citation Index)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库。SCI(科学引文索引)、EI(工程索引 )、ISTP(科技会议录索引) 是世界著名的三大科技文献检索系统，是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具，其中以SCI最为重要。 EI检索，EI检索是什么意思？其实就是全球范围内的一个数据库，类似中国的知网。 但是EI可不是什么文章都录入的，被录入的文章都代表着权威与高质量。所以EI被称为全球核心，被每个国家认可。一般用作：硕士毕业、博士毕业、评副教授、评正教授使用。作者在国际会议或者国际杂志上发表论文被EI收录后，国内一些权威机构可以出具EI收录证书给作者。 EI检索就是工程索引：《工程索引》（The Engineering Index，简称EI）创刊于1884年，是美国工程信息公司（Engineering information I）出版的著名工程技术类综合性检索工具。EI检索每月出版1期，文摘3万至4万条；每期附有主题索引与 作者索引；每年还另外出版年卷本和年度索引，年度索引还增加了作者单位索引。收录文献几乎涉及工程技术各个领域。例如：动力、电工、电子、自动控制、矿 冶、金属工艺、机械制造、管理、土建、水利、教育工程等。EI检索具有综合性强、资料来源广、地理覆盖面广、报道量大、报道质量高、权威性强等特点。
生物信息学领域的专门期刊:Bioinformatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。另外还有Briefings in Bioinformatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+次一点的杂志，如BMC Bioinformatics，也是生物信息学的专刊。对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。
Bio informatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。2012年度IF=468 另外还有Briefings in Bio informatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+，2012年度IF=202。 稍次一点的杂志，如BMC Bio informatics，也是生物信息学的专刊。2012年度IF=447 对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。2012年度IF=215 除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。2012年度IF=276。PLOS Biology也是很好的杂志，2012年度IF=452。PLOS One也会经常有生物信息学文章，但被批灌水太多，算不得牛刊，2012年度IF=092。生物信息学相关的文章不一定要发到专门的生物信息学杂志，因为生物信息学作为一个工具，已经融入到很多生物问题的研究中，而不仅仅是一门孤立的学科了。
这类没有自己生产的bench data的文章通常不太可能发布到最最顶尖的杂志，比如Nature或者Science的主刊。投文章时可以分为四个梯队：第一梯队：Nature Methods, 只要能发上面基本上就保证了关注度和引用，也会有很多人follow的；Genome Research, 很老牌的杂志了，文章的质量都很高，当然了editor大部分文章都是直接拒的。Nature Biotechnology,纯方法的文章很难发上来的，一般都是很大的组既有方法又有实验数据。楼主可参见Clinks和That那篇文章，很多个co-author，做了非常多的测序实验来验证。Nature Genetics，同样，很少有纯方法的文章，除非你在圈内已有很大影响力，比如CADD那篇文章。上面有一大堆做统计和GWAS的人，感觉不太欢迎machine learning的文章。第二梯队：Genome Biology, 比较新的杂志，近几年有一些不错的文章。Nature Communication, 非常新的杂志，基本上每期都会有一些生信类的文章。感觉影响因子在不断上涨，顶着Nature的头衔自然不会缺少好文章。审稿周期非常久，不建议需要短时间内发文章毕业的高年级博士。第三梯队：这一类别的杂志就很多了，Bio informatics曾经是最好的生信杂志，近几年因为文章数量太多灌水严重影响因子有所下降。Nucleic Acid Research也是专业的生信杂志。除了这些，Plod系列的Plod Genetics和Plod Computational Biology也都是接受生信文章的不错的杂志。Human Molecular Biology近几年也开始接受生信文章。第四梯队：如果被之前所有杂志都拒了，那基本上在国际上能够得到认可的杂志也就不多了。Explosion和BMC系列是最后选择了。
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《网络与信息安全学报》是由 人民邮电出版社主办的信息安全领域的学术刊物。什么核心期刊 都不是，普通期刊罢了，但也算是 普通国家级期刊吧。